开题报告内容：（包括拟研究或解决的问题、采用的研究手段及文献综述，不少于2000字）
拟研究或解决的问题
随着抗生素的广泛使用及滥用，耐药性致病菌的数量急剧增加，现有的抗生素治疗效果不断降低，寻找新的抗生素已成为新的重要途径。内共生菌是一类与宿主共同生存的一类的微生物菌群，由于其生长环境的特殊性，进而形成了独特的生理生化性质，为我们从中寻找结构新颖活性良好的药物先导化合物提供了可能。
Streptoseoulmycin是由海洋放线菌IFB-A01（分离自中国对虾）发酵培养后产生，经过体外抗菌活性实验，结果表明该化合物有显著的抗厌氧活性。Streptoseoulmycin对幽门螺旋杆菌具有良好且特异的天然产物，但是其生物合成方面的研究尚未进行。本课题将通过全基因组测序，获得产生streptoseoulmycin菌株的全基因组并进行分析，定位到其生物合成基因簇，进行功能注释，预测生物合成途径。并通过分子生物学手段对该菌株内部的基因簇进行异源表达，以激活内部沉默基因簇。
采用的研究手段
本研究主要使用的技术是基因组测序技术，基因注释，基因敲除和TAR克隆技术。需要的仪器有可控温摇床，PCR仪，离心机，水浴锅，凝胶电泳仪等常规分子生物学仪器。
1.基因测序 测出整个基因组DNA的碱基对排列顺序
2.基因注释 采用比对方法对全基因组测序的基因功能进行注释
3.基因敲除 针对某个序列已知但功能未知的序列，改变生物的遗传基因，令特定的基因功能丧失作用，从而使部分功能被屏障，并可进一步对生物体造成影响，进而推测出该基因的生物学功能。
4.TAR克隆技术 直接从基因组中分离目的序列，不需要提前建立基因组文库，只要将基因组DNA和线性化的TAR载体共同转染到酵母原生质体中，利用酵母细胞中高效的重组体系，使载体和基因组的同源序列进行重组，将目的片段重组到TAR载体中，即可产生带有目的片段的YACs克隆。
