基于计算生物学方法的Cbl-b底物识别机制探究开题报告一、拟解决问题Cbl-b（Casitas B-lineage lymphoma proto-oncogene B）是一种RING类型的泛素E3连接酶，参与细胞中多种底物的泛素化。
Cbl-b能够抑制多种免疫细胞如T细胞、NK细胞、B细胞等的激活，被证明是重要的免疫检查点。
[1]开发其靶向抑制剂在肿瘤免疫治疗中有着巨大的应用潜力。
目前Cbl-b小分子抑制剂的报道极少，开发难度大，而研究Cbl-b与底物肽段之间的蛋白-蛋白相互作用是降低Cbl-b小分子抑制剂开发难度的有效手段。
故本项目拟解决的问题是通过研究Cbl-b的底物识别机制，明确肽-蛋白互作的结合热点区域，预判关键的氨基酸残基和建立蛋白互作的特征模型。
本项目获得的Cbl-b底物识别结构信息可为后续小分子抑制剂的发现奠定结构基础。
二、研究方法计算生物学通过计算手段解决生物学相关问题，是研究肽-蛋白相互作用的有效手段。
本项目拟采用分子动力学模拟和结合自由能计算的计算生物学方法分析Cbl-b底物基序、明确肽-蛋白相互作用热区以及建立二者互作的特征模型。
具体的研究方法首先是利用生物物理学和化学生物学技术，优选底物基序建立基于荧光偏振和基于生物膜干涉的Cbl-b两种靶标水平联合活性评价体系。
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